Villa de Leyva, 17 Aralık 1954 tarihinde ulusal anıt olarak kabul edilmiştir. Bu tarihi kasabayı ziyaret edenler, 115 milyon yıl öncesine dayandığı tahmin edilen Ichthyosaurus, Pilosaurus ve Kronosaurus gibi tarih öncesi sürüngenlerin fosilleşmiş kalıntılarının sergilendiği müzeleri mutlaka ziyaret etmelidir.
Araştırmacılara göre, bölgedeki insan varlığı 12 bin yıl öncesine kadar uzanmaktadır. Kasabada bulunan Zaquencipa Gözlemevi, Sachica ve Iguanque piktografları, İspanyol öncesi çanak çömlek ve heykel parçaları gibi arkeolojik buluntular, Muisca kültürünün zengin mirasını yansıtmaktadır. Villa de Leyva’nın güzelliği ve Kolombiya tarihine katkısı, ulusal anıt statüsünü hak etmesini sağlamaktadır.
